Ganador de premios en concursos coreográficos en diversas ocasiones (Premio Volnine en 1984, y Premio del Concurso Internacional de Nyon en 1984 y 1985), finaliza su carrera de bailarín en 1986 para fundar la compañía Temps Présent. La compañía se instala en Elancourt, en el departamento de las Yvelines, para posteriormente trasladarse a Saint-Etienne, en calidad de "Compañía Asociada" a la Esplanade Saint-Etienne Opéra. Después de encontrarse a la cabeza de esa compañía durante doce años, su trabajo será recompensado con numerosos galardones, entre los cuales cabe destacar el Premio de la Fundación de la Vocación, de la Fundación de Francia, de la Fundación Oulmont y el premio "Nuevo Talento" de la SACD.

En 1998, año de la creación del Centro Coreográfico Nacional - Ballet Biarritz, la Ministra de Cultura Catherine Trautman le nombra director del mismo.

Thierry Malandain es autor de unas cuarenta coreografías, algunas de las cuales forman parte del repertorio de otras compañías:

Ballet Florida, Singapore Danco Theatre, Ballet Contemporáneo de Caracas, Ópera de El Cairo, Joven Ballet de Québec, Joven Ballet Internacional de Cannes, Ballet Real de Flandes, Ballet Real de Valonia, Ballet de San Carlo de Nápoles, Ballet del Rhin, Ballet del Norte, Ballet Nacional de Nancy, Ballet de Nantes, Ballet de Niza, Euro Ballet de Luxemburgo, Ballet de Stadtteater de Karlsruhe, Ballet Nacional Tunecino, Capitolio de Toulouse, Escuela del Ballet Real de Flandes, CNSM de París.

Sus incursiones en el ámbito del teatro lírico también son dignas de mención: sus colaboraciones con Robert Fortune (Cenicienta, Orfeo en los Infiernos, Cándido), Peter Busso (Capriccio), Alberto Fassini (Aïda), Jean-Louis Pichon (Ricardo Corazón de León, Hérodiade) o Frédéric Pineau (La Poule Noire).

Nombrado Caballero de la Orden de las Artes y las Letras en el año 2000 por la Ministra de Cultura Catherine Tasca, ha asumido la dirección artística del festival de danza "Le Temps d'Aimer" que tiene lugar durante el mes de septiembre en Biarritz.